首先，制作动画需要的人员包括编剧、绘师、配音、音效制作等，这些人员工资成为动画制作的主要成本。一般来说，动画制作公司会将这些成本算入最终收费中，也就是常说的总报价。
总报价包括三个部分：制作费用、版权使用费和税收部分。其中，制作费用是指直接与制作动画有关的成本，如人员工资、器材租赁等。版权使用费是指在使用动画过程中所需支付的版权费用，比如在电视通告、广告、宣传片中使用动画需要付出的版权费。税收部分则是指以上两部分之和，按照国家税务法规定的应税价值所交纳的税费。
简单来说，制作一部动画的总报价是由制作费用、版权使用费和税收部分组成的。其中，制作费用与版权使用费是动画制作的主要成本，税收部分则由国家税务部门对应纳税人从总报价中计算而来。
在动画制作过程中，收费也有不同方式。除了最常见的总报价外，还有按照用工时间付费、按照完成度付费、按照项目分期付费等方案。这些方案的选择具体根据具体情况而定，但需要注意的是，无论采用哪种收费方式，都需要遵循国家税务法规进行报税和缴税。
在税务问题上，为了避免税务纠纷，建议动画制作公司与客户在合同签订前，详细商定各种费用明细及信息披露。例如，在税务部分中，可以明确制作费用、版权使用费和税收部分的具体含义，并约定实现方式、计算标准和缴纳时间。同时，为了避免财务混乱，在开票时也需注意按照实际情况开具发票，不得虚开或少开。
总的来说，动画制作的收费可以通过总报价、用工时间、项目分期等多种方式进行，但在收费过程中仍需遵循国家税务法规，合理分配各种费用、并准确开票。同时，建议动画制作公司在与客户签订合同前，详细商定费用明细和信息披露，避免产生税务纠纷。